Abstracto

Los análisis de acoplamiento molecular de fitoquímicos de plantas herbáceas africanas muestran actividad inhibidora contra objetivos terapéuticos del SARS-Cov-2

Goni AbrahamDogo, Uchechukwu Ohaeri, Uzal Umar, Aboi J. Madaki, John C. Aguiyi

Las enfermedades virales siguen siendo la principal causa de muerte debido a agentes infecciosos a nivel mundial. En la actualidad, la amenaza mundial para la salud pública de preocupación internacional es el síndrome respiratorio agudo severo por coronavirus-2 (SARS-CoV-2), el agente causante de la enfermedad por coronavirus-2019 (COVID-19) de prevalencia mundial. Las plantas de todo el mundo, incluidas las plantas de relevancia etnofarmacológica africana, son una fuente natural de fitoquímicos abundantes y diversos con bioactividad contra microorganismos, incluidos los virus. Seleccionamos 13 plantas utilizadas en la medicina tradicional africana para el tratamiento de enfermedades virales para detectar fitoquímicos capaces de interferir con los objetivos terapéuticos del síndrome respiratorio agudo severo por coronavirus-2 (SARS-CoV-2) utilizando el enfoque in silico de acoplamiento automático de Vina . Se evaluaron 25 fitoquímicos de estas plantas que pasaron la regla de Lipinski de similitud con fármacos para determinar la actividad antiviral contra tres objetivos terapéuticos del SARS-CoV-2, a saber: glicoproteína Spike, proteasa similar a la papaína y proteinasa similar a 3C. La estructura cristalina de las proteínas diana virales se obtuvo del sitio web del banco de datos de proteínas (https://www.rcsb.org/). Los sitios activos de las proteínas diana se predijeron utilizando el servidor SCFBio (http://www.scfbio-iitd.res.in/dock/ActiveSite.jsp) a partir del archivo pdb como entrada. Los compuestos fitoquímicos herbales antivirales se acoplaron luego con la proteasa similar a la papaína, la proteinasa similar a 3C y la glicoproteína Spike. Los resultados del acoplamiento automático generaron seis fitoquímicos principales de los veinticinco (25) fitoquímicos obtenidos de las hierbas tradicionales africanas con potencial actividad anti-SARS-CoV-2. Las moléculas principales con sus afinidades de unión contra la proteasa similar a la papaína y la proteinasa similar a 3C son las siguientes: ginsenósidos (-9,9), ácido ursólico (-9,4), ácido oleanólico (-9,4), cinarina (-8,9), glabridina (-8,5) y cinamoilequinadiol (-8,2). Abogamos por más estudios in vitro e in vivo para evaluar la actividad de estos compuestos principales con vistas a una intervención farmacológica optimizada contra la pandemia de COVID-19.