Abstracto

Detección de módulos relacionados con la pared celular en todo el genoma de Mycobacterium tuberculosis basada en análisis de coexpresión a gran escala

Huaidong Wang, Bingqiang Liu, Zhuoyuan Xin, Zipeng Duan, Xiaoyu Sun, Yan Lin, Zhifeng Yang, Guoqing Wang*, Fan Li*

La pared celular de Mycobacterium tuberculosis desempeña un papel importante en la patogénesis. Es imposible analizar los genes asociados a la pared celular uno por uno debido a la falta de anotación funcional. Aquí, realizamos un análisis de agrupamiento de los datos de expresión de microarrays de genes y adquirimos 33 módulos de coexpresión mediante la construcción de redes correguladas de tres nodos. Se predijo un total de 555 genes relacionados con la pared celular en los módulos utilizando un modelo de regresión logística multifactorial y un análisis de predicción de motivos. El análisis de módulos identificó 15 genes sin anotación que también estaban asociados con la pared celular. Veinticinco módulos contenían motivos significativos y los genes en 10 de estos 25 módulos compartían un motivo común. El enfoque metodológico utilizado en este estudio puede aplicarse a la identificación y descripción de otros genes asociados a funciones en el genoma de M. tuberculosis. Los resultados de este estudio podrían mejorar la comprensión de la pared celular de M. tuberculosis y la búsqueda de nuevos objetivos para los medicamentos antituberculosos.