Abstracto

Biomodelado computacional y análisis de la estructura 3D del protooncogén humano c-Rel: una proteína activadora de la tumorigénesis

Atala Bihari Jena y Shasank Sekhar Swain

Con el advenimiento de la investigación biomédica en el campo de las ciencias humanas, se han encontrado varias proteínas en el cuerpo humano que actúan como un peligro para la salud. La proteína proto-oncogen c-Rel se encuentra principalmente en humanos, está codificada por el gen REL y pertenece a la familia de factores de transcripción Rel/NF- kB, que regula una gran variedad de funciones celulares. El proto-oncogen está involucrado y juega un papel importante en la diferenciación y la linfopoyesis. El proto-oncogen puede ser dañino y causar cáncer cuando está mutado. Para comprender el mecanismo operativo de la proteína proto-oncogen c-Rel HUMANO, es imperativo comprender el modelo estructural de esa proteína en particular, pero la estructura tridimensional (3D) aún no se ha informado en el Protein Data Bank (PDB). En el presente estudio se realizó un análisis estructural completo y un modelado tridimensional del protooncogén humano c-Rel de Homo sapiens. Con base en el informe PDB Blast, se predijo la estructura tridimensional de la proteína protooncogén c-Rel utilizando el MODELO SWISS. El modelo predicho se evaluó adicionalmente mediante SAVES (PROCHEK, VERIFY 3D, ERRAT) y Ramachandran Server, que mostraron puntuaciones aceptables y la confiabilidad del modelo final refinado. El resultado general proporciona evidencia de la buena calidad del modelo y proporciona una base adecuada para el análisis funcional de las estructuras cristalinas derivadas experimentalmente y también ayuda en la investigación del cáncer al proporcionar un nuevo punto de partida para el diseño de fármacos basado en la estructura de la proteína protooncogén c-Rel.