Abstracto

Un modelo de pronóstico para el carcinoma hepatocelular basado en el ARN largo no codificante relacionado con la ferroptosis

Congyue Zhang1,2, Chaoqun Zhang1,2, Huifang Zhou2, Zhankai Hu1, Dianxing Sun2*

Antecedentes: El carcinoma hepatocelular (CHC) es una neoplasia maligna prevalente en todo el mundo y la ferroptosis es un proceso de muerte celular dependiente del hierro. Además, la expresión aberrante de ARN largos no codificantes (lncRNA) que contribuyen al desarrollo y progresión del CHC ha suscitado un creciente interés.

Materiales y métodos: Recopilamos perfiles de expresión de lncRNA asociados con ferroptosis e información clinicopatológica de las bases de datos The Cancer Genome Atlas (TCGA) y FerrDb. La relación entre los lncRNA relacionados con ferroptosis (FRlncRNA) y la supervivencia de los pacientes con CHC se determina mediante análisis de coexpresión de la supervivencia global (OS). Utilizando el análisis de regresión de Cox y el algoritmo LASSO, se desarrolló un modelo pronóstico de lncRNA de 22 lncRNA expresados ??diferencialmente.

Resultados: El perfil de lncRNA de alto riesgo se asoció con un mal pronóstico en el carcinoma hepatocelular, según lo determinado por un análisis de Kaplan-Meier. Al predecir el pronóstico del carcinoma hepatocelular, nuestro modelo de evaluación de riesgos superó los datos clínicos convencionales. La GSEA descubrió vías relacionadas con el sistema inmunitario y el tumor en individuos de alto y bajo riesgo. Además, la TCGA reveló que las funciones de las células T, como las células B, los macrófagos citolíticos, el MHC de clase I, los mastocitos, los neutrófilos, las células NK, las células T auxiliares, el IFN de tipo I y el IFN de tipo II, diferían significativamente entre los grupos de alto y bajo riesgo. Los puntos de control inmunitarios también se expresaron de manera diferencial entre los grupos de riesgo, incluidos TNFSF18, IDO2, CD276, NRP1 y TNFSF4.

Conclusión: Basándonos en los lncRNA asociados con la ferroptosis, nuestros hallazgos proporcionan un modelo sólido de pronóstico y predicción de la respuesta inmune para pacientes con CHC.