La Microbiología Farmacéutica es una rama aplicada de la Microbiología. Implica el estudio de microorganismos asociados con la fabricación de productos farmacéuticos, por ejemplo, minimizar la cantidad de microorganismos en un entorno de proceso, excluir microorganismos y subproductos microbianos como exotoxinas y endotoxinas del agua y otros materiales de partida, y garantizar que el producto farmacéutico terminado sea estéril. Revistas de microbología farmacéutica: Microbiología aplicada y ambiental, Revista de microbiología clínica, Microbiología molecular, Reseñas de microbiología clínica, Microbiología y biología molecular, Reseñas de microbiología de la naturaleza, Revisión anual de microbiología, Microbiología y biotecnología aplicadas, Tendencias en microbiología.