Abstracto

Análisis comparativo del genoma del cloroplasto de Suaeda aralocaspica con el de otras Amaranthaceae

Caburatan L, Parque J*

Los cloroplastos son orgánulos semiautónomos necesarios para el sistema de fabricación de alimentos de las plantas. Los genomas de los cloroplastos se estudian ampliamente en la actualidad para el análisis comparativo que puede ayudar a dilucidar las diferencias entre especies de la misma familia de plantas. Suaeda aralocaspica es una especie de planta unicelular C4 que pertenece a la familia Amaranthaceae bajo la subfamilia Suaedoideae. Sin embargo, no todas las especies de plantas de Suaedoideae utilizan la fotosíntesis C4 ya que la mayoría de sus especies de plantas utilizan la fotosíntesis C3. Por lo tanto, este estudio tiene como objetivo evaluar el genoma del cloroplasto de S. aralocaspica y realizar un análisis comparativo con otras cuatro especies de Amaranthaceae. El genoma del cloroplasto de S. aralocaspica se obtuvo mediante el aislamiento del cloroplasto y la secuenciación del ADN, así como mediante el ensamblaje y la anotación del genoma. La comparación del genoma se realizó mediante el análisis de la secuencia de genes, así como la determinación de repeticiones en tándem. S. aralocaspica tiene una longitud de 151.225 pb con un tamaño de codificación de 77.517 pb. Tiene un total de 140 genes, 86 de los cuales son codificadores de proteínas. Hay 20 genes duplicados tanto en IRa como en IRb y hay 16 genes que contienen intrones. Los resultados de la identidad de secuencia del 70% mostraron que S. aralocaspica variaba con otras especies de manera más aparente en la disposición de algunos genes como matK, atpF, rpoC2, rpoC1, ycf6, psbM, clpP, petB, rpl16, ndhA y ycf1. Se encontró un total de 66 repeticiones en tándem en todas las especies estudiadas, la mayoría de las cuales se encuentran en el espacio intergénico. El análisis comparativo del genoma del cloroplasto mostró que S. aralocaspica está mucho más cerca de Suaeda glauca y un poco en variación con Suaeda acuminata y el grupo externo, Salsola tragus.