Raheesa M Khatib, Veena y Neelamma Konanavar
El diagnóstico temprano de enfermedades es esencial para reducir las enfermedades desde la etapa de plántulas hasta la cosecha, con el fin de obtener un cultivo saludable para obtener el máximo rendimiento. La detección de bacterias es el rastreo de bacterias patógenas de plantas en el material vegetal o sobre él, especialmente cuando se presentan de forma latente, sin causar síntomas. Pero la identificación significa aislamiento, caracterización y denominación de bacterias. Es un paso importante en el diagnóstico de infecciones bacterianas y en los estudios taxonómicos. No existe un método exclusivo o confiablemente simple para identificar patógenos y la enfermedad que causan. Los métodos de identificación tradicionales son la inspección visual del patógeno in situ o in vitro en cultivo puro mediante examen microscópico, reacción de tinción, caracteres de colonias, requerimiento de oxígeno, caracteres fisiológicos, caracteres bioquímicos y métodos serológicos. La identificación mediante la técnica de bacteriófagos puede considerarse tanto tradicional como moderna. La menor especificidad y menor discriminación a nivel de especie y cepa es el inconveniente de los métodos de identificación convencionales. En los últimos años se han desarrollado técnicas de identificación completamente nuevas. Esto se debe principalmente al desarrollo de la biología molecular, que desentraña la estructura y función de los microorganismos. El conocimiento de la composición y el lugar de los elementos estructurales en los microorganismos ha hecho posible el uso de métodos de identificación de huellas dactilares, como métodos serológicos especiales como la inmunoelectroforesis, los anticuerpos monoclonales y el marcaje con inmunooro. La identificación por separación de componentes bacterianos utilizando técnicas cromatográficas (análisis FAA por cromatografía de gases), separación de proteínas bacterianas (PAGE). Los métodos de identificación basados ??en ácidos nucleicos son más importantes porque se basan puramente en la genética. La hibridación in situ fluorescente (FISH), desarrollada por Christoph Lengauer, se basa en la hibridación ADN-ADN. La RFLP se basa en la hibridación Southern. Uno de los avances importantes en los estudios genómicos es el descubrimiento de la PCR por Kary Mullis en 1985. Los métodos de identificación basados ??en PCR son RFLP-PCR, PFGE, RAPD, REP-PCR, AFLP, PCR en tiempo real y BIO-PCR a nivel de trazador de la infección por las bacterias, especialmente importante para la cuarentena.