Abstracto

Entropía informativa en la COVID-19: un análisis global de la evolución de los genomas

 Elidamar Nunes

A principios de 2020 se produjo el brote de COVID-19 causado por un nuevo coronavirus, un síndrome respiratorio agudo severo. Comprender las características genómicas evolutivas y las posibles nuevas firmas-mutaciones que puedan estar ocurriendo es fundamental para el desarrollo de mecanismos de control. En este sentido, el foco de este trabajo es analizar la observación del mapa estructural tridimensional y evolutivo de estas proteínas, para su posterior uso en el reconocimiento de patrones genómicos de firma que puedan ser útiles en el desarrollo de fármacos y vacunas específicas, basados ??en la información y evolución de este genoma. Objetivo: En este sentido, este estudio tuvo como objetivo cuantificar la información genómica de las secuencias de COVID-19 disponibles en GISAID (febrero de 2020 a julio de 2020), a través de la Entropía Informacional de Shannon en un metaanálisis de 89.000 secuencias genómicas computadas en diferentes continentes y diferentes grupos de edad. Resultados: Se identificó un aumento de la información genómica tanto en diferentes grupos de edad como en la geolocalización, asociado a la dependencia del tiempo en todas las secuencias analizadas. Esta búsqueda está asociada a la comprensión de patrones de variabilidad genómica y mutacional, donde con los resultados obtenidos se realizó un Mapa genómico de estas firmas mostrando el patrón evolutivo temporal, basado en la variabilidad, entropía informacional, así como en diferencias genómicas informacionales (delta y entropía relativa) de los epítopos de unión, especialmente la región genómica Spike (sitio de unión de la proteína S y del receptor RBS), con el propósito de seleccionar epítopos funcionales que posteriormente fueron comparados con otras especies fuente de coronavirus (Camello, pangolín y murciélago). Conclusiones: Utilizando la entropía informacional masiva de los sitios de unión de la proteína Spike del coronavirus, nuestros hallazgos proporcionan un conjunto de epítopos seleccionados que pueden ayudar a guiar los esfuerzos experimentales hacia el desarrollo de vacunas contra el SARS-CoV-2.