Abstracto

Estudio comparativo sobre la proteína transportadora de retinol en dos peces de agua dulce, Danio rerio y Cyprinus carpio

Chittaranjan Baruah, Papari Devi y DK Sharma

Las proteínas transportadoras de retinol (RBP) son una familia de proteínas con diversas funciones. Son proteínas transportadoras que se unen al retinol. Se ha realizado un estudio in silico para la predicción de la estructura 3D y el análisis filogenético molecular de las RBP de dos peces de agua dulce, Danio rerio y Cyprinus carpio . Los análisis se realizaron utilizando datos de secuencia del gen rbp y de la proteína transportadora de retinol, extraídos de las bases de datos Gen Bank y UNIPROKB/SWISSPROT respectivamente. Los análisis evolutivos del gen rbp se han realizado en MEGA5 mediante los métodos de máxima verosimilitud y máxima parsimonia. El presente estudio representa la aplicación de un modelado comparativo para la predicción de la estructura 3D de las RBP y los análisis filogenéticos moleculares del gen rbp en MEGA5, utilizando dos métodos diferentes, a saber, máxima parsimonia y máxima verosimilitud. Las estructuras predichas se depositaron en la base de datos del modelo de proteínas (PMDB) después de la verificación estadística. El estudio muestra que el gen rbp de Cyprinus carpio es el ortólogo más cercano del gen rbp de Denio rerio. Las estructuras de RBP pueden ser útiles en biología estructural para futuras investigaciones sobre sitios activos, mecanismos moleculares de función y filogenia basada en la estructura. La estructura será útil para comprender mejor las interacciones del complejo RBP-retinol con la transtiretina en peces de agua dulce. El árbol filogenético reveló la relación evolutiva de la familia RBP.